MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Candidatus Portiera aleyrodidarum BT-QVLC chromosome

Total Repeats: 4128

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018676	T	6	6	2995	3000	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018676	TGT	2	6	3004	3009	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018676	TATT	2	8	3023	3030	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018676	TCT	2	6	3062	3067	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_018676	GTT	2	6	3073	3078	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018676	T	8	8	3104	3111	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018676	T	6	6	3115	3120	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018676	T	9	9	3122	3130	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018676	T	7	7	3150	3156	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018676	TTA	3	9	3161	3169	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018676	GTT	2	6	3170	3175	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018676	T	7	7	3191	3197	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018676	TTATT	2	10	3203	3212	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018676	TGTTT	2	10	3222	3231	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018676	TTTTG	2	10	3247	3256	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018676	TGTA	2	8	3267	3274	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018676	TGT	2	6	3282	3287	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018676	AGTA	2	8	3294	3301	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018676	AGT	2	6	3309	3314	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018676	ATA	2	6	3335	3340	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018676	ATG	2	6	3342	3347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018676	T	6	6	3367	3372	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018676	TGT	2	6	3400	3405	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018676	ATT	2	6	3412	3417	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018676	TAAT	2	8	3422	3429	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018676	A	8	8	3430	3437	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018676	AT	4	8	3447	3454	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018676	GTTT	2	8	3496	3503	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018676	GGTT	2	8	3517	3524	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018676	TATT	2	8	3536	3543	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018676	TTA	2	6	3545	3550	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018676	TTTA	2	8	3583	3590	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018676	TAT	2	6	3645	3650	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018676	TTA	2	6	3651	3656	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018676	TAAAA	2	10	3710	3719	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018676	GTT	2	6	3727	3732	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018676	CTGTTG	4	24	3743	3766	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_018676	A	7	7	3786	3792	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018676	TAT	2	6	3817	3822	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018676	TTA	3	9	3823	3831	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018676	T	6	6	3848	3853	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018676	GTT	2	6	3862	3867	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018676	TAAAG	2	10	3880	3889	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018676	GTA	2	6	3899	3904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018676	A	6	6	3904	3909	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018676	TAT	2	6	3927	3932	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018676	T	7	7	3939	3945	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018676	TAA	3	9	3952	3960	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018676	AAC	2	6	3964	3969	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_018676	CAA	2	6	3983	3988	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_018676	ACAAA	2	10	3989	3998	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
52	NC_018676	TAA	2	6	4025	4030	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018676	ACA	2	6	4031	4036	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_018676	AAC	2	6	4067	4072	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_018676	TAA	2	6	4088	4093	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018676	ACA	2	6	4094	4099	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_018676	TAC	2	6	4126	4131	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_018676	AACA	2	8	4151	4158	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
59	NC_018676	TA	3	6	4165	4170	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018676	AAC	2	6	4191	4196	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_018676	A	7	7	4216	4222	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018676	ACAA	2	8	4257	4264	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_018676	A	9	9	4266	4274	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018676	A	8	8	4301	4308	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018676	AATTA	2	10	4315	4324	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018676	AAAT	2	8	9276	9283	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018676	CGA	2	6	9299	9304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_018676	TAA	2	6	9307	9312	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018676	A	6	6	9328	9333	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018676	ATA	2	6	9345	9350	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018676	TCTAT	4	20	15869	15888	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
72	NC_018676	T	9	9	17532	17540	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018676	ACA	2	6	17547	17552	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_018676	T	9	9	17589	17597	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018676	T	6	6	17603	17608	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018676	ATA	2	6	17611	17616	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018676	TAA	2	6	18624	18629	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018676	A	6	6	18640	18645	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018676	CAA	2	6	18648	18653	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_018676	T	9	9	18678	18686	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018676	ATTG	2	8	18689	18696	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018676	T	6	6	18697	18702	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018676	TTAG	2	8	18704	18711	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018676	TGTA	2	8	18724	18731	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_018676	GAT	2	6	18733	18738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018676	TTG	2	6	18741	18746	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018676	T	6	6	18807	18812	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018676	TGT	2	6	18894	18899	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_018676	TG	3	6	18992	18997	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018676	A	8	8	19049	19056	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018676	TTTA	2	8	19569	19576	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018676	TA	3	6	19595	19600	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018676	ACC	2	6	19630	19635	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
94	NC_018676	TTTCT	2	10	19642	19651	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
95	NC_018676	TAC	2	6	19723	19728	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_018676	T	7	7	19750	19756	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_018676	TAA	2	6	19777	19782	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_018676	AAAC	2	8	19796	19803	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
99	NC_018676	CAA	2	6	19846	19851	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_018676	TC	3	6	19859	19864	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NC_018676	TTTA	2	8	19867	19874	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_018676	CAA	2	6	19903	19908	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_018676	TATT	2	8	19921	19928	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_018676	AAC	2	6	19929	19934	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_018676	T	8	8	19981	19988	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_018676	TTG	2	6	19991	19996	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_018676	T	7	7	20019	20025	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_018676	ATT	2	6	20044	20049	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_018676	TAT	2	6	20062	20067	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_018676	CT	3	6	20090	20095	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_018676	CTT	2	6	20120	20125	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_018676	T	8	8	20127	20134	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_018676	TTA	2	6	20144	20149	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_018676	TGT	2	6	20213	20218	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_018676	T	10	10	20233	20242	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_018676	TAT	2	6	20247	20252	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_018676	TTA	2	6	20288	20293	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_018676	TTTA	2	8	20362	20369	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_018676	AT	3	6	20372	20377	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_018676	TAT	2	6	20393	20398	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_018676	TGTAGT	2	12	20413	20424	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_018676	T	10	10	20497	20506	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_018676	T	8	8	20538	20545	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_018676	TTA	2	6	20550	20555	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_018676	TCT	2	6	20559	20564	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_018676	TGT	2	6	20574	20579	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_018676	TGTTT	2	10	20601	20610	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
128	NC_018676	A	7	7	20622	20628	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_018676	TTA	2	6	20659	20664	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_018676	TGC	2	6	20692	20697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_018676	ATT	2	6	20770	20775	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_018676	AGA	2	6	20797	20802	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_018676	GTTA	2	8	20816	20823	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
134	NC_018676	TGT	2	6	20833	20838	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_018676	GTT	3	9	20889	20897	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_018676	T	8	8	20905	20912	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_018676	T	6	6	20921	20926	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_018676	T	7	7	20936	20942	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_018676	GTT	2	6	20943	20948	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_018676	T	6	6	20958	20963	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_018676	TGTT	2	8	20968	20975	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
142	NC_018676	TTTTG	2	10	21043	21052	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
143	NC_018676	TTTA	2	8	21060	21067	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_018676	TGT	3	9	21073	21081	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
145	NC_018676	T	7	7	21121	21127	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_018676	TAT	3	9	21143	21151	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_018676	T	6	6	21151	21156	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_018676	TGT	2	6	21173	21178	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
149	NC_018676	TGT	2	6	21180	21185	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
150	NC_018676	TAT	2	6	21224	21229	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_018676	TGT	2	6	21261	21266	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
152	NC_018676	ATTAT	2	10	21270	21279	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_018676	TGT	2	6	21307	21312	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
154	NC_018676	TAA	2	6	21318	21323	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_018676	TTGA	2	8	21361	21368	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
156	NC_018676	TTTTA	2	10	21395	21404	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_018676	TGTA	2	8	21409	21416	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
158	NC_018676	TAT	2	6	21421	21426	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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160	NC_018676	CTTTT	2	10	21470	21479	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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163	NC_018676	TATT	3	12	21519	21530	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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178	NC_018676	TGTGT	2	10	21838	21847	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
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181	NC_018676	TGT	2	6	21889	21894	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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188	NC_018676	TG	5	10	22145	22154	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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448	NC_018676	ACT	2	6	42078	42083	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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465	NC_018676	AAC	2	6	42404	42409	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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468	NC_018676	A	6	6	42421	42426	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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